自然史部門
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| 番号 | 部門別 | 標本内訳 | 資料名 | 資料数 | 備考 | 写真番号及び 写真名 |
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| 1 | 地質部門 | 岩石 | 県内岩石標本・礫岩 | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 2 | 県内岩石標本・砂岩 | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 3 | 県内岩石標本・泥岩 | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 4 | 県内岩石標本・石灰岩 | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 5 | 県内岩石標本・チャート | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 6 | 県内岩石標本・花崗岩 | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 7 | 県内岩石標本・安山岩（霧島系） | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 8 | 県内岩石標本・花崗斑岩 | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 9 | 県内岩石標本・阿蘇溶結凝灰岩 | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 10 | 県内岩石標本・尾鈴溶結凝灰岩 | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 11 | 県内岩石標本・姶良溶結凝灰岩 | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 12 | 県内岩石標本・頁岩 | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 13 | 県内岩石標本・赤色頁岩 | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 14 | 県内岩石標本・緑色岩 （玄武岩質火山岩類） |
1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 15 | 県内岩石標本・蛇紋岩 | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 16 | 鉱物 | 石英（大崩山産） | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 17 | 長石（大崩山産） | 1 | 標本箱1箱 （岩片複数・さわれる） |
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| 18 | 灰ばんザクロ石 | 2 | 標本箱2箱 （結晶20個・さわれる） |
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| 19 | 水晶をふくむ石英岩塊 | 6 | 10～20cm程度の岩塊・さわれる |  |
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| 20 | 化石 | 宮崎層群産貝化石 | 8 | 貝化石を多数ふくむ岩塊・さわれる |  |
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| 21 | モロッコ産アンモナイト | 1 | 直径20cm・さわれる |  |
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| 22 | アンデス産三葉虫 | 9 | 小型ノジュール・さわれる |  |
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| 23 | 教材用化石標本50個セット | 8 | 標本箱2段組 |  |
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| 24 | 始祖鳥全身骨格 | 1 | レプリカ |  |
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| 25 | 人類頭骨(エジプトピクテス・ズーシス) | 1 | レプリカ |  |
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| 26 | 人類頭骨(プロコンスル・アフリカヌス) | 1 | レプリカ |  |
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| 27 | 人類頭骨(アウストラロピテクス・アファレンシス) | 1 | レプリカ |  |
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| 28 | 人類頭骨(アウストラロピテクス・アフリカヌス) | 1 | レプリカ |  |
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| 29 | 人類頭骨(パラントロプス・エチオピクス) | 1 | レプリカ |  |
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| 30 | 人類頭骨(パラントロプス・ロブストス) | 1 | レプリカ |  |
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| 31 | 人類頭骨(パラントロプス・ボイセイ) | 1 | レプリカ |  |
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| 32 | 人類頭骨(ホモ・ハビリス) | 1 | レプリカ |  |
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| 33 | 人類頭骨(ホモ・ルドルフェンシス) | 1 | レプリカ |  |
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| 34 | 人類頭骨(ホモ・エルガスター) | 1 | レプリカ |  |
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| 35 | 人類頭骨(ホモ・エレクトス 0H9) | 1 | レプリカ |  |
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| 36 | 人類頭骨(ホモ・エレクトス サンギラン17） | 1 | レプリカ |  |
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| 37 | 人類頭骨(ホモ・エレクトス 北京原人) | 1 | レプリカ |  |
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| 38 | 人類頭骨(ホモ・ハイデルベルゲンジス) | 1 | レプリカ |  |
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| 39 | 人類頭骨(ホモ・ネアンデルターレンシス アムッド１号） | 1 | レプリカ |  |
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| 40 | 人類頭骨(ホモ・ネアンデルターレンシス ラ・シャペローサン3号） | 1 | レプリカ |  |
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| 41 | 人類頭骨(ホモ・ネアンデルターレンシス ラ・フェラシー） | 1 | レプリカ |  |
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| 42 | 人類頭骨(港川人) | 1 | レプリカ |  |
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| 43 | 人類頭骨(クロマニヨン人) | 1 | レプリカ |  |
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| 44 | 人類頭骨(現代人 ホモ・サピエンス) | 1 | レプリカ |  |
